根据企业会计准则第16号――政府补助（2017）-第一章 总则-第五条，下列各项适用其他相关会计准则：（一）企业从政府取得的经济资源，如果与企业销售商品或提供服务等活动密切相关，且是企业商品或服务的对价或者是对价的组成部分，适用《企业会计准则第14号——收入》等相关会计准则。因此，甲公司为当地政府开发的交通管理系统取得的价款500万元，应视为销售商品或提供服务的对价，适用收入准则，而不是作为政府补助处理。

根据企业会计准则第16号――政府补助（2017）-第一章 总则-第二条，政府补助是指企业从政府无偿取得货币性资产或非货币性资产。退回的增值税额80万元和当地政府给予的开发高新技术设备补助款100万元，均属于政府补助。

根据企业会计准则第16号――政府补助（2017）-第二章 确认和计量-第十一条，与企业日常活动相关的政府补助，应当按照经济业务实质，计入其他收益或冲减相关成本费用。与企业日常活动无关的政府补助，应当计入营业外收支。因此，退回的增值税额80万元应作为政府补助确认为其他收益。

对于当地政府给予的开发高新技术设备补助款100万元，由于设备于2×20年9月30日投入使用，且预计使用10年，采用年限平均法计提折旧，因此2×20年度应确认的政府补助收益为100万元/10年×3个月/12个月 = 2.5万元。

免征企业所得税150万元，根据企业会计准则第16号――政府补助（2017）-第一章 总则-第五条，所得税减免，适用《企业会计准则第18号——所得税》，不适用政府补助准则。

综上所述，正确的选项是A，退回的增值税额作为政府补助确认为其他收益。