根据企业会计准则第1号—存货（2006）中关于先进先出法的规定，存货发出时应按照先购入的存货先发出的原则确定其成本。在本例中，3月10日发出甲材料900千克时，应先发出3月1日库存的500千克，然后发出3月5日购入的400千克。因此，该企业发出的甲材料实际成本为3000元（3月1日库存）加上剩余400千克的单位成本乘以400千克。3月5日购入甲材料的单位成本为7440元除以1200千克，即6.2元/千克。所以，400千克的成本为400千克 × 6.2元/千克 = 2480元。两者相加，得出该企业发出的甲材料实际成本为3000元 + 2480元 = 5480元。