根据《关于印发<城乡居民基本医疗保险实施办法>的通知》（人社部发〔2016〕121号），基本医疗保险的缴费主体包括企业、机关事业单位、灵活就业人员及城乡居民四类。因此，选项A是正确的。

选项B中提到的城乡居民基本医疗保险由用工单位和个人共同缴纳，个人的缴费率一般为本人工资收入的2%，这一描述不符合实际情况。城乡居民基本医疗保险的缴费通常由个人和政府共同承担，且不以工资收入为基数。

选项C中提到由职工个人缴纳基本医疗保险费，这一描述不全面。实际上，职工的基本医疗保险费是由单位和个人共同缴纳的。

选项D中提到目前生育保险基金并入职工基本医疗保险基金，统一征缴，统筹层次一致。这一描述符合《关于印发<生育保险和职工基本医疗保险合并实施试点方案>的通知》（人社部发〔2017〕60号）的规定，因此选项D也是正确的。

综上所述，正确答案是A和D。

参考文件： 1. 《关于印发<城乡居民基本医疗保险实施办法>的通知》（人社部发〔2016〕121号） 2. 《关于印发<生育保险和职工基本医疗保险合并实施试点方案>的通知》（人社部发〔2017〕60号）

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