根据您提供的信息，评估报告是由专业评估机构出具的，该评估机构应按照相关法律法规、《资产评估准则》及依法制定的其他业务规则勤勉执业。税务部门通常会认可由合格评估机构出具的评估报告，前提是评估过程符合相关法律法规和评估准则，并且评估结果合理、公正。

然而，税务部门是否最终认可评估报告，还需要根据具体情况进行审查。税务部门可能会对评估报告的合理性、评估方法的适当性以及评估结果的准确性进行审核。如果税务部门认为评估报告存在问题，可能会要求企业提供更多的证明材料或进行调整。

因此，虽然评估报告通常会被税务部门认可，但最终是否被接受还需根据税务部门的审查结果确定。企业在使用评估报告进行税务申报时，应确保评估报告的合法性和准确性，并准备好可能需要的额外证明材料。