员工工资通过往来款支付的情况，从会计处理的角度来看，这并不符合常规的做法。通常，员工工资应通过“应付职工薪酬”科目进行核算，并在实际支付时借记该科目，贷记“银行存款”等科目。如果工资通过往来款支付，可能会导致会计记录不准确，混淆了正常的经营性现金流与非经营性或临时性的资金流动。

正确的做法是，首先将应付的工资记入“应付职工薪酬”科目，然后在实际支付时，借记“应付职工薪酬”，贷记“银行存款”。这样做能清晰地反映企业的薪酬支付情况，并符合企业会计准则的要求，确保财务报表的准确性。如果工资长期通过往来款支付，可能需要检查是否存在规避税收或其他合规性问题。