公允价值套期和现金流量套期的主要区别在于它们管理的风险类型和会计处理方式。公允价值套期用于对冲现有资产、负债或确定承诺的公允价值变动风险，目的是影响损益或其他综合收益。而现金流量套期则是针对未来现金流量变动风险的套期，旨在影响未来的损益。

在会计处理上，公允价值套期的套期工具利得或损失通常计入当期损益，除非被套期项目是特定的非交易性权益工具投资，此时利得或损失计入其他综合收益。现金流量套期的套期工具有效部分的利得或损失计入其他综合收益，待被套期项目影响损益时转出，无效部分则计入当期损益。

区分这两种套期的关键在于识别被套期项目和套期目标。如果套期目标是管理未来现金流量的不确定性，那么这通常是现金流量套期。如果套期目标是稳定资产、负债或确定承诺的公允价值，那么这可能是公允价值套期。企业需要根据具体情况进行判断，并确保符合套期会计准则的要求。