根据企业会计准则第33号——合并财务报表（2014）的规定，判断是否应将被投资方纳入合并范围的基础是控制权的存在。通常，持有被投资方半数以上的表决权是拥有控制权的一个重要标志，但在支付了50%的股权对价款但未完成工商变更的情况下，A公司是否能将B公司并表，还需要考虑其他因素，如A公司是否能主导B公司的相关活动，包括但不限于任命关键管理人员、决定或否决重大交易、对董事会的控制等。如果A公司能够证明其在支付了50%的股权后，实际上已经控制了B公司的财务和经营政策，那么即使工商变更手续正在进行中，理论上可以将B公司纳入合并范围。然而，如果变更手续未完成，可能存在控制权的不确定性，因此在并表决策上需要谨慎。