甲公司2021年度取得政府补助的金额是与销售新能源汽车相关的补贴。根据提供的信息，每销售一辆新能源汽车政府给予补贴¥50,000，但没有说明具体销售了多少辆。因此，我们需要知道销售数量来计算总补贴金额。如果甲公司2021年销售了800辆新能源汽车（这个数字仅为示例，实际数字需要根据实际情况确定），那么政府补贴的总额将是800辆 * ¥50,000 = ¥4,000,000。

其他事项： 2. 研发费用的加计扣除政策是一项税收优惠，而不是直接的政府补助，因此不计入政府补助金额。 3. 抵免企业所得税额是税收优惠，同样不是政府补助。 4. 即征即退的增值税是与销售相关的税收返还，属于与收益相关的政府补助，应当计入政府补助金额。如果甲公司收到的即征即退增值税为¥2,000,000，则这部分应计入政府补助。

所以，甲公司2021年取得的政府补助金额至少为新能源汽车补贴加上增值税退款，即¥4,000,000 + ¥2,000,000 = ¥6,000,000。如果实际销售的新能源汽车数量不同，这个总额也会相应变化。