根据企业会计准则，子公司将其在建工程转至母公司的账上，通常涉及企业集团内部交易的处理。如果母公司和子公司在同一控制下，这种转移通常被视为内部资产转移，不会立即反映在合并财务报表中，因为内部交易的利润没有实现对外的经济效果。合并财务报表时，需要抵销子公司的在建工程和母公司的相应资产，同时抵销未实现的内部利润。

具体操作步骤如下： 1. 子公司层面：子公司不再继续确认在建工程，而是将其账面价值转移到内部应收账款，表示母公司欠款。 2. 母公司层面：母公司记录接收的在建工程，同时记录对子公司的内部负债，相当于从子公司购买了在建工程。 3. 合并报表层面：在编制合并财务报表时，需要抵销子公司的在建工程和母公司的内部应收账款，同时抵销未实现的内部利润（如果有的话）。

请注意，这个过程需要遵循母子公司间交易的会计原则，确保合并报表中不包含内部交易的影响，真实反映集团的财务状况。如果在建工程尚未达到预定可使用状态，那么在合并报表中可能需要考虑资本化利息的处理。如果在建工程已经完工，可能还需要涉及固定资产的确认和折旧的计算。