生产成本与存货科目的关系体现在企业生产过程中成本的流转和结转。根据企业会计准则，生产成本主要包括直接材料、直接人工和制造费用，这些成本在生产期间被归集在“生产成本”科目中。当生产完成并验收入库成为产成品时，生产成本会从“生产成本”科目转移到“库存商品”科目，这时存货的账面价值相应增加。

如果采用实际成本法，生产完成的产成品按实际成本入账，借记“库存商品”，贷记“生产成本”。若采用计划成本法，借记“库存商品”按计划成本，贷记“生产成本”，同时按实际成本与计划成本的差异借记或贷记“材料成本差异”科目，以调整存货的账面价值至实际成本。

在销售产成品时，结转销售成本，借记“主营业务成本”，贷记“库存商品”，这反映了存货的减少和当期损益的确认。

因此，生产成本与存货科目的勾稽关系表现为生产成本的积累和结转直接影响存货的增减变动，以及主营业务成本的计算。通过比较生产成本科目的借方发生额与存货科目和主营业务成本科目的变动，可以检查成本计算的准确性。