小规模纳税人在出租房屋时，如果月租金收入扣除销售不动产的销售额后未超过10万元，其销售货物、劳务、服务、无形资产取得的销售额是免征增值税的。如果月租金收入超过了10万元，那么需要按照5%的征收率计算应交增值税。

在收取租金时，小规模纳税人应做以下会计处理： 1. 计算应交增值税： 假设租金收入为X元，不含税租金为Y元（X = Y / (1 + 5%)），则应交增值税为X - Y。

1. 确认收入： 借：银行存款 X 贷：其他业务收入 Y

2. 计提增值税： 借：应交税费——应交增值税（销项税额） X - Y 贷：其他业务成本 X - Y

3. 如果月租金收入未超过10万元的免税限额，这笔增值税不需要实际缴纳，而是直接减免。如果超过了10万元，小规模纳税人需要按照规定缴纳增值税。

4. 实际缴纳增值税时，按照实际支付的金额： 借：应交税费——应交增值税（已交税金） 贷：银行存款

请注意，这里的处理是基于小规模纳税人的增值税政策，如果政策有变动，应根据最新的税法规定进行调整。