将公司装修厂房的资金流经员工个人账户而非通过公司账户，可能会带来一些潜在风险，包括但不限于：

1. 税务问题：这种做法可能引起税务合规性问题，因为公司支出应通过正式的财务渠道进行，以确保准确记录和报告税务信息。如果被税务机关发现这种操作，可能会引发税务调查，因为这可能被视为试图逃避税务记录和报告的要求。

2. 法律责任：如果通过员工账户支付，一旦发生纠纷，公司可能失去法律保护，因为合同和付款记录可能不被视为合法的商业交易，这可能导致法律纠纷。

3. 内部控制缺陷：这种操作违反了基本的内部控制原则，因为它混淆了个人财务与公司财务，增加了财务舞弊和错误的风险。

4. 审计和合规性：在年度审计或接受任何形式的外部审查时，这种做法可能会引起关注，可能导致审计调整和/或罚款。

5. 会计不透明：这种资金流转方式可能导致财务报表的不透明，使得跟踪和理解公司的实际财务状况变得困难。

6. 员工责任：如果通过员工账户付款，员工可能面临个人财务责任，如果出现问题，他们可能被卷入法律纠纷或债务追偿。

因此，建议公司遵守正常的财务流程，通过公司账户进行所有业务相关的财务交易，以确保透明度、合规性和风险管理。