当企业有一批存货平价转移给关联方公司并在本期末仍有挂账的情况下，清理掉这笔挂账的会计分录通常涉及以下几个步骤：

1. 首先，需要确认存货转移的会计处理是否符合终止确认条件。如果企业仍然需要对这批存货的损益负责，那么应该根据《企业会计准则第23号——金融资产转移（2017）》中关于继续涉入被转移金融资产的会计处理的规定来操作。

2. 如果存货转移不满足终止确认条件，企业应当继续确认被转移的存货，并相应确认相关负债。这意味着在清理挂账时，企业需要将这部分存货从资产科目中转出，同时确认与之相关的负债。

3. 如果存货是通过销售或其他方式清理，相应的会计分录可能涉及将存货从“库存物品”科目转出，减少相应金额，同时根据实际情况，可能需要确认为“应收账款”或“其他应收款”，以反映企业对关联方的债权。

4. 如果存货是由于亏损而出售，那么需要将亏损的部分从“待处理财产损溢”科目转出，同时确认为费用或损失。

请注意，具体的会计处理应当根据实际的交易性质和管理层的意图来确定。如果存货是通过销售处理，那么需要将这部分存货从“库存物品”科目转出，减少相应金额，同时确认销售收入或营业收入。如果存货是由于亏损而出售，那么需要将亏损的部分从“待处理财产损溢”科目转出，同时确认为费用或损失。