股东将对公司借款转化为股权出资款通常涉及一个债务重组的过程，这种转换通常需要一份正式的债务重组协议或者股权认购协议。在协议中，应当详细说明以下内容：

1. 债务详情：明确列出股东原有的借款金额、利率、还款期限等详细信息。
2. 债务转股权条款：详细规定债务如何被转换为股权，包括转换比率、价格以及其他相关条件。
3. 估值和定价：确定转换后的股权价值，可能基于借款的本金、利息或其他计算方式。
4. 股东协议：新产生的股权结构和股东权利和义务。
5. 税务和法律后果：考虑到可能涉及的税务影响和法律后果，如债务豁免的税务处理和股权登记变更等。
6. 生效条件和时间：协议何时生效，以及转换的具体时间点。
7. 陈述和保证：各方需要提供的陈述和保证，包括债务人和债权人的责任和权利。
8. 争议解决机制：如果发生纠纷时的解决方式和程序。

此外，根据企业会计准则，此类交易可能需要遵循权益性交易的会计处理规定，特别是当股东以股权出资的方式清偿债务时，可能会影响公司的所有者权益和资本结构，因此需要谨慎处理并确保所有法律和监管要求得到满足。