根据企业会计准则，当企业以非货币性资产对外投资时，如果发生资产评估增值，这部分增值通常会根据不同的情况有不同的处理方式。如果投资是非同一控制下的企业合并，增值部分可能会计入投资成本，并反映在长期股权投资的账面价值中。如果投资是向子公司或联营企业投资，且企业会计准则规定允许的情况下，评估增值部分可能计入资本公积，特别是当企业进行公司制改建时，评估增值通常会调整所有者权益，包括资本公积（资本溢价或股本溢价）。

例如，如果母公司以非货币性资产向子公司投资，且资产的评估价值高于其账面价值，母公司的个别报表中，评估增值可能确认为长期股权投资的成本，而子公司则会按照评估价值入账，这可能导致子公司资本公积的增加。在合并报表层面，如果子公司是全资子公司，评估增值可能不会影响资本公积，而是体现在母公司对子公司的投资账面价值中。

因此，是否计入资本公积取决于具体的投资性质、投资对象以及适用的会计准则和税法规定。在实际操作中，应根据具体情况和当地法规来确定会计处理方式。