当最终控制方向其子公司注资时，这通常被视为同一控制下的企业合并的一部分。根据企业会计准则，此类交易中，子公司增加的净资产应按照最终控制方合并财务报表中的账面价值确认。最终控制方对子公司的长期股权投资应相应调整，以反映其在子公司中增加的权益份额，差额调整资本公积，资本公积不足冲减的，再调整留存收益。

具体来说，如果最终控制方通过向子公司注入资本导致子公司所有者权益增加，那么这个增加额在合并财务报表中应按照最终控制方账面上的金额体现，而不是按照公允价值。同时，最终控制方的长期股权投资应相应增加，增加额与子公司所有者权益增加额相匹配，差额同样调整资本公积和留存收益。

需要注意的是，这种处理方式假设了子公司和最终控制方在合并前就已经在同一控制下，因此不涉及公允价值的计量，而是基于账面价值进行会计处理。