在审计过程中，如果银行回函提供了企业银行资金归集账户的拨入资金余额，审计师应采取以下步骤：

1. 验证准确性：首先，审计师需要对比银行回函中的拨入资金余额与企业财务记录中的数据，确认两者的一致性。任何差异都需要进一步调查。

2. 分析现金流：审计师应分析这些拨入资金的流入和流出，以了解资金的用途和合理性，确保它们与企业的经营活动和财务政策相符。

3. 测试内部控制：评估企业对资金归集的内部控制，确保资金的集中和分配遵循既定的程序，并且有适当的审批和记录。

4. 函证程序：银行回函是审计程序的重要组成部分，审计师应确保回函的完整性和真实性，包括检查回函的签章、日期和发函银行的官方信头。

5. 调整和披露：如果发现需要调整的差异，审计师应建议管理层进行相应的账务调整，并考虑这些调整对财务报表的影响。同时，检查是否需要在财务报表附注中披露相关信息。

6. 结论和报告：基于上述分析，审计师将形成审计意见，如果拨入资金余额的确认无重大疑虑，这将成为审计报告的基础。

通过这些步骤，审计师可以确保拨入资金余额的审计质量，从而提高财务报表的可信度。