在审计在建工程期初余额的准确性时，审计师应执行以下步骤：

1. 获取并复核支持性文件：审计师应要求管理层提供在建工程期初余额的详细清单，包括成本构成、合同文件、采购订单、发票和进度报告等。复核这些文件以确认支出的合理性。

2. 检查会计政策一致性：审计师应确认管理层是否一贯应用会计政策，特别是在资本化利息和停工损失的处理上。

3. 对比前后期数据：比较期初余额与上一年度的期末余额，了解在建工程的变动情况，检查是否有异常波动或未解释的差异。

4. 现场观察和询问：如果可能，审计师应实地查看在建工程，以确认工程的状态和进度，并与管理层讨论项目的当前状态和预期完成时间。

5. 验证重大项目的资本化：对于金额较大的在建工程，审计师应特别关注，可能需要独立验证合同条款、成本估算和资本化日期。

6. 评估减值准备：审计师应评估期初是否存在减值迹象，如果管理层已计提减值准备，审计师需验证其合理性。

7. 函证和第三方确认：向供应商和承包商发送询证函，确认在建工程相关的预付款项和合同金额。

8. 分析程序：审计师可以运用分析程序，比如比较在建工程成本与类似已完成项目的成本，或者分析在建工程成本与工程进度的关系。

9. 考虑内部控制系统：评估管理层的内部控制流程，以确保在建工程的记录和计量准确无误。

通过以上程序，审计师可以得出在建工程期初余额是否公允的结论，并在审计报告中反映其审计结果。