在非同一控制下的企业合并中，A公司被合并后，其合并基准日（即购买日）的货币资金在合并现金流量表中不作为单独的现金流入或流出项目列报。根据企业会计准则，合并方在购买日支付的现金对价通常被归类为筹资活动产生的现金流量，因为这是为了取得对被合并方的控制权而进行的筹资行为。而A公司合并基准日的货币资金余额在合并报表层面会被整合，体现在合并资产负债表的货币资金项目中，而不是直接影响现金流量表。

因此，在合并现金流量表中，A公司的货币资金不会作为一个单独的条目出现，而是体现在合并后的现金及现金等价物的期初余额中，这个余额反映了合并双方（包括A公司）的现金状况。合并现金流量表会反映从合并日到报告期末A公司和合并方共同的现金流入和流出情况。