根据企业会计准则第20号——企业合并（2006）的规定，非同一控制下的企业合并中，购买方在购买日对作为企业合并对价付出的资产、发生或承担的负债应当按照公允价值计量，且在支付了合并价款的大部分（一般认为是超过50%）并且有能力、有计划支付剩余款项时，可以认为实现了控制权的转移。然而，实际控制权的判断不仅依赖于价款支付比例，还需要考虑其他因素，如是否已取得对被购买方的决策权、能否主导被购买方的经营活动等。

在您给出的案例中，虽然A公司已经支付了50%的股权对价款，但如果没有完成工商变更登记，A公司可能还未在法律上获得对B公司的控制权。此外，如果A公司尚未能够对B公司的财务和经营决策实施控制，那么从会计角度，A公司可能还不能将B公司纳入合并财务报表范围。

因此，A公司是否可以将B公司并表，需要综合考虑支付的价款比例、是否已完成工商变更、是否实质上拥有控制权等因素。如果这些条件都得到满足，A公司才能在财务报表中将B公司合并。否则，A公司应当按照权益法核算其对B公司的投资，直到控制权转移的条件达成。