如果公司的净资产为负，这意味着其负债超过资产。在非同一控制下的企业合并中，收购对价应基于目标公司的公允价值来确定，而不是其账面净资产价值。根据企业会计准则第20号——企业合并（2006），购买方应以公允价值计量合并对价，即使目标公司的净资产为负值。

如果目标公司的公允价值高于其账面净资产（包括负净资产），那么购买方将根据公允价值支付对价，并可能形成商誉。相反，如果目标公司的公允价值低于其账面净资产，购买方可能支付较少的对价，但这不会直接导致负商誉的确认，因为商誉是正的合并对价超过可辨认净资产公允价值的差额。

在确定对价时，购买方还需要考虑其他因素，如未来现金流、市场情况、品牌价值、客户关系等无形资产的公允价值。如果这些因素使得目标公司具有高于账面价值的经济价值，那么收购对价可能会高于账面上的负净资产。最终，收购对价的确定应基于全面的公允价值评估。