员工行权时，会计处理如下：

1. 确认收入：
2. 当员工行权购买公司股份时，企业应将收到的价款（如果有的话，如行权价格低于市价）确认为收入。

3. 如果行权价格等于市价，可能没有现金流入，但仍然需要进行会计处理。

4. 转销库存股：

5. 企业应转销在等待期内已确认的库存股成本，即在“库存股”科目中记录的金额。

6. 调整资本公积：

7. 转销等待期内已确认在“资本公积——其他资本公积”中的累计金额。

8. 根据行权的权益工具数量，将这部分资本公积转入“资本公积——股本溢价”科目。

9. 增加股本：

10. 按照行权的权益工具数量，增加“实收资本”或“股本”科目，反映员工行权后对公司资本的增加。

11. 差额处理：

12. 如果转销的库存股成本和资本公积的累计金额之间存在差额，应调整“资本公积——股本溢价”科目。

会计分录示例（假设行权日收到的价款为X元，行权的权益工具数量为Y股，库存股成本为Z元，等待期内资本公积累计金额为A元）：

借：库存股        -Z元
借：资本公积——其他资本公积  -A元
贷：实收资本/股本    Y元 * 行权价格
贷：资本公积——股本溢价  (X+Z-A)元

请注意，具体会计处理可能因企业具体情况和会计政策而略有不同。