在同一集团内，甲公司替乙公司支付奖金并代为申报个税的情况，可以视为集团内部的往来交易处理。甲公司支付奖金时，应借记“其他应收款”科目，贷记“银行存款”科目，同时，由于甲公司承担了乙公司的个税义务，乙公司应偿还甲公司这部分金额。乙公司在收到甲公司提供的个税金额后，应借记“应付职工薪酬”或相关成本费用科目，贷记“其他应付款”科目，以反映乙公司对甲公司的负债。

当甲乙公司平账时，乙公司偿还甲公司支付的奖金及个税，甲公司应借记“银行存款”科目，贷记“其他应收款”科目，乙公司则作相反的分录，借记“其他应付款”科目，贷记“银行存款”或相关成本费用科目。这样，甲乙公司之间的财务关系得以平衡。

请注意，这种处理方式基于集团内部交易的简化处理，具体会计处理还需结合集团内部的会计政策和实际情况，确保符合企业会计准则的要求。