根据企业会计准则，公司通过美团从事电商业务时，美团扣取的平台服务费通常被视为公司获得销售收入的一部分成本。因此，这笔费用应当作为销售费用处理，计入公司的经营成本。在会计处理上，可以这样做：

1. 当公司确认销售收入时，应将美团的平台服务费从总收入中扣除，以得到净销售额。
2. 将扣除服务费后的净销售额确认为营业收入。
3. 将美团的平台服务费计入销售费用，借记“销售费用”科目，贷记“银行存款”或相关负债科目，如“应付账款”（如果尚未支付）。

这样，美团的平台服务费就被合理地纳入了公司的成本结构，反映了实际的销售利润。