在项目经济财务效益分析中，增值税进项税的计算通常涉及到以下几个步骤：

1. 确定可抵扣的进项税额：识别项目中可以抵扣的增值税支出，这通常包括购买原材料、设备、服务等产生的增值税。企业需要取得合法有效的增值税专用发票或其他扣税凭证。

2. 计算当期可抵扣的进项税：根据增值税政策，有些进项税可能需要在取得后的一段时间内分期抵扣，例如，购入的不动产或在建工程的进项税可能按年分摊抵扣。

3. 抵扣销项税额：将计算出的可抵扣进项税额与项目的销项税额（即销售产品或服务产生的增值税）相比较。销项税额减去进项税额的差额就是企业实际需要缴纳的增值税。

4. 考虑未抵扣的进项税：如果当期的销项税额小于进项税额，未抵扣的部分可以结转到下期继续抵扣，或者根据具体情况可能需要进行转出处理。

5. 特殊情况下进项税的处理：如果项目中某些支出的进项税不得抵扣，例如用于非应税项目、简易计税项目或免税项目，这部分进项税应做转出处理，不计入抵扣。

在财务效益分析中，通常会假设一个合理的抵扣比例或根据实际情况预测每年的进项税和销项税，以估算项目的税收负担和净现金流。要注意的是，具体的计算方法和政策可能会随着当地税法的变化而更新，所以要参照最新的税法规定进行计算。