土地使用权和上面的建筑物通常是分开核算的。根据企业会计准则，土地使用权作为无形资产核算，而建筑物作为固定资产核算。但如果土地使用权是为建造对外出售的房屋建筑物而取得的，那么相关的土地使用权应计入所建造的房屋建筑成本，作为存货核算。如果土地使用权和建筑物用于出租或资本增值，那么在满足投资性房地产的定义时，土地使用权的价值应按建筑物中对外出租部分的比例转入投资性房地产的成本。如果企业改变土地使用权的用途，从自用转为出租，土地使用权的价值也需要按比例转入投资性房地产。

简而言之，土地使用权和建筑物是否合并取决于它们的用途和会计处理模式。在某些情况下，两者可能合并入一个资产类别，如存货或投资性房地产，但在其他情况下则保持独立。具体的会计处理应根据实际情况和相关会计准则进行。