证明部分履行合同时，企业需要准备以下文件和信息来支持入账依据：

1. 修订后的合同或协议：显示部分履行的新条款或补充协议。

2. 工作进度报告：详细记录已完成的工作量或交付的货物，包括时间、成本和质量。

3. 发票和收款记录：根据部分履行的情况开具的发票，以及收到的客户付款记录。

4. 成本计算和收入确认计算：展示如何根据部分履行计算成本和收入的计算表。

5. 客户确认函：客户确认部分履行和接受服务或产品的书面文件。

6. 内部审批文件：管理层关于部分履行的决策记录，包括任何变更的批准。

7. 沟通记录：与客户的电子邮件、信函或会议纪要，证明双方就部分履行达成一致。

这些文件应能清晰地证明企业已经按照合同部分履行了义务，并且这种履行得到了客户的认可，同时也反映了相应的收入和成本。在会计处理上，企业应根据这些文件确认部分履行的收入和成本，确保符合企业会计准则第14号关于收入确认的规定。