根据材料成本差异的核算方法，材料成本差异率的计算公式为：

[ 本期材料成本差异率 = \frac{期初结存材料的成本差异 + 本期验收入库材料的成本差异}{期初结存材料的计划成本 + 本期验收入库材料的计划成本} \times 100\% ]

在本例中，期初结存材料的成本差异为贷方余额2万元，意味着实际成本低于计划成本2万元。本月入库材料计划成本100万元，实际成本98万元，因此本期入库材料的成本差异为贷方余额2万元（100万元 - 98万元）。

发出材料的成本差异不直接影响材料成本差异率的计算，它只影响“生产成本”等科目的金额。

现在我们可以计算材料成本差异率：

[ 本期材料成本差异率 = \frac{20,000 + 20,000}{200,000 + 100,000} \times 100\% ] [ 本期材料成本差异率 = \frac{40,000}{300,000} \times 100\% ] [ 本期材料成本差异率 = 0.1333 \times 100\% ] [ 本期材料成本差异率 = 13.33\% ]

所以，月末材料成本差异率为13.33%。