根据企业会计准则第16号——政府补助（2017年修订）-第二章 确认和计量-第七条：政府补助为非货币性资产的，应当按照公允价值计量；公允价值不能可靠取得的，按照名义金额计量。

在这个案例中，基金会甲收到乙公司捐助的一辆已使用两年的汽车，捐赠协议确定的价格为20万元，类似二手汽车的市场价格为15万元。根据会计准则，非货币性资产的捐赠应当按照公允价值计量。由于捐赠协议确定的价格和市场价格不一致，基金会甲应当选择更为公允的市场价格作为入账金额。

因此，基金会甲对于收到上述捐赠资产应入账的金额是市场价格，即15万元。

综上所述，正确答案是B.15万元。