针对短期借款的存在、完整性、准确性、计价和分摊认定，注册会计师应执行以下审计程序：

1. 存在认定：
2. 审查银行借款合同和借据，确认借款事实。
3. 函证银行，确认借款余额和条件。

4. 比较银行对账单与账面记录。

5. 完整性认定：

6. 检查借款的授权文件，确保所有借款已记录。

7. 通过检查财务部门的记录，确认没有遗漏的借款。

8. 准确性认定：

9. 核算借款的本金和利息，确保计算无误。

10. 分析借款的利率，确认符合合同约定。

11. 计价和分摊认定：

12. 确认短期借款的初始计量正确，包括借款费用的资本化或费用化处理。

13. 检查利息费用的计算和分摊，确保符合会计政策。

14. 截止测试：

15. 确保借款和利息费用的记录在正确的会计期间。

16. 审计程序的替代：

17. 对于无法函证的借款，可能需要依赖其他审计证据。

18. 分析性程序：

19. 分析借款余额的变化趋势，与企业的资金需求相匹配。
20. 比较借款成本与市场利率，评估合理性。

通过这些程序，注册会计师能够获取充分、适当的审计证据，以支持短期借款的审计结论。