在审计过程中，应收账款的函证是确认应收账款余额真实性和准确性的关键程序。如果回函金额与应收账款记录不符，审计师需要采取以下步骤：

1. 分析差异原因：审计师应要求被审计单位提供回函不符的调节表，列出导致差异的具体事项。这可能包括时间性差异（例如，款项在函证日期之后收到）或货物在途的情况。

2. 检查期后收款：对于时间性差异，审计师应检查期后的收款凭证，确认款项是否在之后的期间内确实被收到。

3. 验证货物在途：如果差异源于货物运输，审计师应查看发货单、运单或销售合同，以确定收入是否应在报告期间确认，防止收入被不恰当地提前确认。

4. 考虑商业实质：审计师需要判断差异是否与交易的商业实质有关，例如，是否涉及收入截止性或真实性的问题。如果差异是由于客户账务处理错误，审计师应建议客户进行调整。

5. 执行替代程序：如果函证不可靠或未收到回函，审计师需要执行替代审计程序，以获取其他相关且可靠的审计证据。

6. 保持职业怀疑：对于大额第三方回款或异常情况，审计师应保持警惕，审查相关协议，并可能需要执行额外的审计程序以验证交易的真实性。

7. 处理不符事项：根据《中国注册会计师审计准则》，审计师应评估不符事项对审计工作和审计意见的影响，可能需要考虑出具非无保留意见的审计报告。

综上所述，应收账款回函的审计不仅涉及函证的准确性，还涉及对差异的深入调查和对审计证据的全面评估。